网站备案的主管部门是各国的通信管理局。由于互联网管理涉及方方面面的问题，因此备案管理之间也存在一定的分工，在中国，备案管理主要由国家互联网信息办公室和各个省份的通信管理局负责。
在中国，备案管理通过《互联网信息服务管理办法》、《互联网新闻信息服务管理规定》等法律法规进行规范。其中，国家互联网信息办公室是主管全国网络安全和信息化工作的部门，承担着互联网行业的整治与管理工作。该部门负责协调和指导各个地方政府的互联网信息工作，推动各项互联网事业的发展和规范。
而具体执行网站备案的部门则是各省市的通信管理局。这些部门通过建立备案管理制度，要求网站按照相关规定进行备案，并维护备案信息系统。备案过程中，通信管理局会对网站的基本信息、经营范围、安全保障措施等进行审核，确保网站的合法性和安全性，以避免不良信息的传播和网络安全的风险。
通信管理局的主要职责包括：
1.制定和实施网络安全和信息化方面的政策、法规和标准。
2.对互联网服务提供商和网站进行注册、备案和监管，确保互联网服务的合法性和安全性。
3.管理和维护国家的互联网基础设施，如域名系统和互联网节点。
4.开展网络安全和信息化方面的研究和宣传，提升社会公众的安全意识和素质。
总之，通信管理局在网站备案中扮演着重要的角色。他们通过制定相关的法律法规和管理制度，对网站进行审核和监管，维护互联网服务的合法性和安全性，推动互联网行业的健康发展。