网站备案信息会因“空壳备案”、备案信息不符、违规网站、信息举报而被注销，具体为：

“空壳备案”一旦发现就给注销。所谓的空壳备案就是备案好，没有接入商的备案或者网站备案已经通过，该域名没有相关内容。这也是目前网站备案被注销的关键。
备案信息不符。备案信息不符分为：备案名称、网站内容、备案联系人等信息与备案信息不符而被注销。
网站违规、违法而被注销。
网站发布虚假信息或引起网友损失，传播不实言论对他人有损害等行为被人举报而引起备案注销。
常见情形：
空壳备案：
A、网站没有接入商，该情况常见于自助备案。如：提交备案信息中接入商是万网，实际并无使用万网相关主机服务。

B、网站无内容。 如：网站备案为百度，域名为baidu.com，而打开该域名一片空白。

备案信息不符：
A、备案名称不符，如：备案为百度网，打开是网站标题是游戏网。
B、网站内容不符，如：备案为百度网，打开内容是金融网，或者打开是广告内容。
C、联系人不符，如：在备案信息中联系人是李某，电话028-8888XXX，工信部或者通信管理局复核时无法拨通，或者拨通联系人非李某。
网站违规、违法，如：备案信息是百度网，打开是成人内容、赌博宣传或者是传销内容等。
网站宣传或者传播不实言论，如：某广告内容肆意夸大效果，引起使用后并无效果，或者网站传播损害他人合法权益的内容。